گروه بندی و بررسی الگوی بیان ژن های خانواده bzip در ریشه گیاه گوجه فرنگی تحت تنش دمای پایین
نویسندگان
چکیده
bzip یکی از مهمترین عوامل رونویسی هستند که در اکثر تنشها فعال هستند و باعث بیان و تنظیم تعدادی زیادی ژن در طی تنشهای محیطی میشوند. گیاه گوجه فرنگی دارای 73 ژن bzip است که تاکنون این ژنها گروهبندی نشدهاند. در این تحقیق با استفاده از مطالعه نواحی فعالیت و اتصال به dna، این خانواده بزرگ از عوامل رونویسی گروهبندی گردید. نتایج گروهبندی نشان داد که bzips گوجهفرنگی طبق عملکرد و میزان همولوژی با ژنهای bzip آرابیدوپسیس در یازده گروه قرار میگیرند. سه ژن solyc06g074320، solyc01g109880 و solyc10g085210 به ترتیب از گروههای d، i و b برای مطالعه بیان ژن تحت تنش دمای پایین انتخاب شدند. دو ژنوتیپ حساس به سرما (moneymaker) و مقاوم به سرما (la1777) گیاه گوجه فرنگی در مرحله گیاهچهای تحت شرایط دمای نرمال (23 درجه سانتیگراد) و دمای پایین (15 درجه سانتیگراد) برای مطالعه بیان ژن در ریشه کشت گردیدند. نتایج نشان داد که ژن solyc06g074320 کمتر از solyc01g109880 و solyc10g085210 تحت تنش دمای پایین در ریشه گیاه گوجهفرنگی القاء میشود. نتایج این بررسی میتواند نقطه شروعی برای مطالعه عملکردی ژنهای خانواده bzip در آینده باشد.
منابع مشابه
گروه بندی و بررسی الگوی بیان ژن های خانواده bZIP در ریشه گیاه گوجه فرنگی تحت تنش دمای پایین
Transcription factors (TFs) are master regulators that control gene clusters Plant bZIP (basic region/leucine zipper) transcription factors play crucial roles in biological processes. The Tomato genome sequence contains 73 genes of bZIP transcription factors. The bZIPs in tomato have never been classified. In this study, 73 genes of bZIP transcription factors were classified in 11 groups by th...
متن کاملتأثیر دمای پایین بر بیان ژن های درگیر در مسیر ارسال پیام و ترابری هورمون اکسین در ریشه گیاهچه های گوجه فرنگی
اکسین به عنوان یک هورمون گیاهی دارای نقش چندگانهای در تنظیم رشد و توسعه ساقه، ریشه و سایر اندامها، تحت شرایط طبیعی و یا تنش است. در این تحقیق تغییرات رونوشت ژنهای AUX/IAA، ARF، BRX و PIN4 درگیر در مسیر ارسال پیام و ترابری هورمون اکسین در ریشه ی دو ژنوتیپ متحمل و حساس به سرما گیاه گوجه فرنگی تحت شرایط 15 درجه سانتی گراد مورد بررسی قرار گرفت. ژن AUX/IAA4 که تنظیم کننده منفی ژنهای پاسخ به اکس...
متن کاملتأثیر دمای پایین بر بیان ژن های درگیر در مسیر ارسال پیام و ترابری هورمون اکسین در ریشه گیاهچه های گوجه فرنگی
اکسین به عنوان یک هورمون گیاهی دارای نقش چندگانهای در تنظیم رشد و توسعه ساقه، ریشه و سایر اندامها، تحت شرایط طبیعی و یا تنش است. در این تحقیق تغییرات رونوشت ژنهای AUX/IAA، ARF، BRX و PIN4 درگیر در مسیر ارسال پیام و ترابری هورمون اکسین در ریشه ی دو ژنوتیپ متحمل و حساس به سرما گیاه گوجه فرنگی تحت شرایط 15 درجه سانتی گراد مورد بررسی قرار گرفت. ژن AUX/IAA4 که تنظیم کننده منفی ژنهای پاسخ به اکس...
متن کاملتأثیر دمای پایین بر بیان ژن های درگیر در مسیر ارسال پیام و ترابری هورمون اکسین در ریشه گیاهچه های گوجه فرنگی
اکسین به عنوان یک هورمون گیاهی دارای نقش چندگانه ای در تنظیم رشد و توسعه ساقه، ریشه و سایر اندام ها، تحت شرایط طبیعی و یا تنش است. در این تحقیق تغییرات رونوشت ژن های aux/iaa، arf، brx و pin4 درگیر در مسیر ارسال پیام و ترابری هورمون اکسین در ریشه ی دو ژنوتیپ متحمل و حساس به سرما گیاه گوجه فرنگی تحت شرایط 15 درجه سانتی گراد مورد بررسی قرار گرفت. ژن aux/iaa4 که تنظیم کننده منفی ژن های پاسخ به اکسی...
متن کاملبررسی نواحی تنظیمی در پروموتور ژنهای هم بیان تحت شرایط تنش دمای پایین در گوجهفرنگی
روشهای نسل نوین توالییابی همچون RNA-Seq توانایی ارائه حجم بالایی از اطلاعات در زمینه رونوشت ژنها را دارند. بازسازی شبکه ژنهای همبیان بر اساس اطلاعات حاصل از دادههای RNA-seq اطلاعات ارزشمندی جهت درک سیستم پاسخی گیاهان به تغییرات محیطی را ارائه میدهد. لذا در این تحقیق پروفایل کامل بیانی ژنهای گوجه فرنگی تحت تیمار دمای پایین با استفاده از روش شبکههای هم بیان وزندار مورد آنالیز قرار گرفت....
متن کاملبررسی نواحی تنظیمی در پروموتور ژنهای هم بیان تحت شرایط تنش دمای پایین در گوجهفرنگی
روشهای نسل نوین توالییابی همچون RNA-Seq توانایی ارائه حجم بالایی از اطلاعات در زمینه رونوشت ژنها را دارند. بازسازی شبکه ژنهای همبیان بر اساس اطلاعات حاصل از دادههای RNA-seq اطلاعات ارزشمندی جهت درک سیستم پاسخی گیاهان به تغییرات محیطی را ارائه میدهد. لذا در این تحقیق پروفایل کامل بیانی ژنهای گوجه فرنگی تحت تیمار دمای پایین با استفاده از روش شبکههای هم بیان وزندار مورد آنالیز قرار گرفت....
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
عنوان ژورنال:
پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعیجلد ۸، شماره ۱۷، صفحات ۲۳-۱۷
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023